MicroRNA-938及其靶基因<i>TGFBR1</i>单核苷酸多态性与出血性脑卒中的关联研究

doi:10.3877/cma.j.issn.2095-123X.2019.04.004

中华脑科疾病与康复杂志(电子版) ›› 2019, Vol. 09 ›› Issue (04) : 205 -209. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-123X.2019.04.004

所属专题：文献；

临床研究

MicroRNA-938及其靶基因TGFBR1单核苷酸多态性与出血性脑卒中的关联研究

宋波¹, 程云¹, 姜玉章², 沈冲³, 薛永¹, 李婴慧¹^,^†(

)

^1. 223001　淮安市第三人民医院检验科
^2. 223300　淮安，南京医科大学附属淮安市第一人民医院检验科
^3. 211166　南京，南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系

收稿日期:2019-03-11 出版日期:2019-08-15
通信作者: 李婴慧
基金资助:
国家自然科学基金(81273165); 江苏省自然科学基金(BK2011776); 淮安市科委资助项目(HAS2011027)

Association study between microRNA-938 and TGFBR1 single nucleotide polymorphisms and hemorrhagic stroke

Bo Song¹, Yun Cheng¹, Yuzhang Jiang², Chong Shen³, Yong Xue¹, Yinghui Li¹^,^†()

^1. Department of Laboratory, The Third People’s Hospital of Huai’an, Huai’an 223001, China
^2. Department of Medical Laboratory, Huai’an First People’s Hospital, Nanjing Medical University, Huai’an 223300, China
^3. Department of Epidemiology & Biostatistics School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 211166, China

Received:2019-03-11 Published:2019-08-15
Corresponding author: Yinghui Li
About author:
Corresponding author: Li Yinghui, Email: liyinghui188@126.com

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引用本文：

宋波, 程云, 姜玉章, 沈冲, 薛永, 李婴慧. MicroRNA-938及其靶基因TGFBR1单核苷酸多态性与出血性脑卒中的关联研究[J]. 中华脑科疾病与康复杂志(电子版), 2019, 09(04): 205-209.

Bo Song, Yun Cheng, Yuzhang Jiang, Chong Shen, Yong Xue, Yinghui Li. Association study between microRNA-938 and TGFBR1 single nucleotide polymorphisms and hemorrhagic stroke[J]. Chinese Journal of Brain Diseases and Rehabilitation(Electronic Edition), 2019, 09(04): 205-209.

目的

探讨转化生长因子β受体1（TGFBR1）基因位点rs12346650及结合该基因的miR-938编码基因位点rs2505901单核苷酸多态性（SNP）与出血性脑卒中（HS）的关联。

方法

采用病例-对照研究方式，以自2008年1月至2013年7月淮安市第一人民医院和淮阴区医院收治的239例急性HS患者为病例组，993例无脑卒中史的社区人群为对照组。收集性别、年龄、身高、体质量等基本人口信息，及糖尿病史、高血压病史，测量血压并检测血糖（GLU）、甘油三酯（TG）、胆固醇（TC）、高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）、低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）。采用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）的方法进行基因分型。

结果

病例组和对照组间rs2505901和rs12346650的基因型、等位基因型频率差异均无统计学意义（P>0.05）。应用Logistic回归模型校正混杂因素年龄、性别、Ⅱ型糖尿病、TC、TG、HDL-C和LDL-C后，结果仍无统计学意义（P>0.05）。进一步按性别对两个位点与HS的关联性进行分层分析，男性中rs2505901位点显性模型有统计学意义[比值比（OR）=0.641，95%置信区间（CI）：0.417~0.984]。rs12346650位点相加模型和隐性模型均有统计学意义（OR=1.369，95%CI：1.020~1.836；OR=2.092，95%CI：1.243~3.520）。但校正混杂因素后，模型差异无统计学意义（P>0.05）。在女性人群中，而校正协变量后rs12346650位点隐性模型有统计学意义（OR=0.318，95%CI：0.114~0.891）。

结论

本研究初步发现TGFBR1基因rs12346650、MIR938基因rs2505901多态性与HS存在关联。

关键词: 单核苷酸多态性, 出血性脑卒中, 转化生长因子β受体1, 微小RNA-938

Objective

To investigate the association between rs12346650 G>A polymorphisms in transforming growth factor β receptor 1 (TGFBR1) gene and rs2505901 C>T polymorphisms in microRNA-938 and hemorrhagic stroke (HS).

Methods

A total of 239 patients with acute HS and 993 controls from a community population were recruited in this study. The basic information of age, sex, height, weight, diabetes history and hypertension history were collected, and blood samples were collected to test blood pressure (BP), glucose (GLU), triglycerides (TG), total cholesterol (TC), high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), and low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C). Using polymerase chain reaction-restrictive fragment length polymorphism (PCR-RFLP) to determine genotype.

Results

The genotype frequencies of rs2505901 and rs12346650 have no statistical difference between HS case group and control group as well as after adjusted for age, sex, diabetes history, hypertension history, TC, TG, HDL-C and LDL-C (P>0.05). Further stratification analysis by sex indicated that the dominant genetic model of rs2505901, the additive and recessive model of rs12346650 showed statistical significance for male HS and OR (95%CI) were 0.641 (0.417-0.984), 1.369 (1.020-1.836) and 2.092 (1.243-3.520) respectively. But the association weren’t significant after adjusted for confounding factors as above. For female, the receive model of rs12346650 showed significantly association with HS and the OR(95%CI) was 0.318 (0.114-0.891) after adjusted for confounding factors.

Conclusion

The finding in the present study suggested that there was weak association between MIR938 and TGFBR1 genetic polymorphisms and HS.

Key words: Single nucleotide polymorphisms, Hemorrhagic stroke, Transforming growth factor βreceptor 1, MicroRNA-938

表1 rs12346650和rs2505901位点PCR-RFLP分析引物、限制性内切酶及酶切片段大小

SNPs	引物设计(5 ’-3 ’)	等位基因（内切酶识别）	限制性内切酶	PCR产物及酶切片段长度（bp）
rs12346650	Forward: 5 ’AGGATGGACAAATGAGCAGAA 3 ’	G/A (G)	AvaII	110
rs12346650	Reward: 5 ’ACTTTGAATAACTGCACCAGGTC 3 ’	G/A (G)	AvaII	110
rs2505901	Forward: 5 ’ATGGGGCCCTGGATTATTAGGTT 3 ’	C/T (T)	BseLI	588
rs2505901	Reward: 5 ’TCGGCTTGACCATTTGCATCTT 3 ’	C/T (T)	BseLI	588

表1 rs12346650和rs2505901位点PCR-RFLP分析引物、限制性内切酶及酶切片段大小

SNPs	引物设计(5 ’-3 ’)	等位基因（内切酶识别）	限制性内切酶	PCR产物及酶切片段长度（bp）
rs12346650	Forward: 5 ’AGGATGGACAAATGAGCAGAA 3 ’	G/A (G)	AvaII	110
rs12346650	Reward: 5 ’ACTTTGAATAACTGCACCAGGTC 3 ’	G/A (G)	AvaII	110
rs2505901	Forward: 5 ’ATGGGGCCCTGGATTATTAGGTT 3 ’	C/T (T)	BseLI	588
rs2505901	Reward: 5 ’TCGGCTTGACCATTTGCATCTT 3 ’	C/T (T)	BseLI	588

表2 病例组和对照组人群的一般特征比较

特征变量	病例组（n=239）	对照组（n=993）	χ²/t值	P值
男性	57.9%	40.3%	24.597	<0.001
年龄（岁）	61.75±13.58	63.61±9.09	1.912	<0.001
高血压	74.4%	44.2%	71.578	<0.001
收缩压（mmHg）	155.43±27.96	134.30±19.43	11.166	<0.001
舒张压（mmHg）	93.45±19.99	80.86±12.34	10.821	<0.001
TC（mmol/L）	4.32±1.10	5.32±0.96	12.792	0.013
HDL-C（mmol/L）	1.34±0.36	1.44±0.26	4.212	<0.001
LDL-C（mmol/L）	2.70±0.86	2.29±0.70	6.489	<0.001
TG（mmol/L）	1.52±1.28	1.57±0.88	0.732	<0.001
Ⅱ型糖尿病	7.5%	10.3%	1.702	0.191
GLU（mmol/L）	6.84±2.23	5.97±1.36	4.285	<0.001

表2 病例组和对照组人群的一般特征比较

特征变量	病例组（n=239）	对照组（n=993）	χ²/t值	P值
男性	57.9%	40.3%	24.597	<0.001
年龄（岁）	61.75±13.58	63.61±9.09	1.912	<0.001
高血压	74.4%	44.2%	71.578	<0.001
收缩压（mmHg）	155.43±27.96	134.30±19.43	11.166	<0.001
舒张压（mmHg）	93.45±19.99	80.86±12.34	10.821	<0.001
TC（mmol/L）	4.32±1.10	5.32±0.96	12.792	0.013
HDL-C（mmol/L）	1.34±0.36	1.44±0.26	4.212	<0.001
LDL-C（mmol/L）	2.70±0.86	2.29±0.70	6.489	<0.001
TG（mmol/L）	1.52±1.28	1.57±0.88	0.732	<0.001
Ⅱ型糖尿病	7.5%	10.3%	1.702	0.191
GLU（mmol/L）	6.84±2.23	5.97±1.36	4.285	<0.001

表3 rs2505901、2346650单核苷酸多态性与出血性脑卒中的关联分析

SNPs	组别	基因型，OR（95%CI）				等位基因
SNPs	组别	WT/HT/MT	相加模型	显性模型	隐性模型	常见/少见	OR（95%CI)
rs2505901	?	CC/CT/TT	?	?	?	C/T	?
?	病例组	159/69/9	0.896（0.646~1.243）	0.858（0.581~1.267）	0.985（0.399~2.429）	387/87	0.857（0.663~1.107）
?	对照组	621/328/42	P=0.512	P=0.441	P=0.973	1570/412	χ²=1.398，P=0.237
rs12346650	?	GG/GA/AA	?	?	?	G/A	?
?	病例组	84/116/37	0.983（0.742~1.303）	0.991（0.673~1.460）	0.953（0.545~1.666）	284/190	0.1.094（0.892~1.343）
?	对照组	371/488/132	P=0.907	P=0.965	P=0.638	1230/752	χ²=0.743，P=0.389

表3 rs2505901、2346650单核苷酸多态性与出血性脑卒中的关联分析

SNPs	组别	基因型，OR（95%CI）				等位基因
SNPs	组别	WT/HT/MT	相加模型	显性模型	隐性模型	常见/少见	OR（95%CI)
rs2505901	?	CC/CT/TT	?	?	?	C/T	?
?	病例组	159/69/9	0.896（0.646~1.243）	0.858（0.581~1.267）	0.985（0.399~2.429）	387/87	0.857（0.663~1.107）
?	对照组	621/328/42	P=0.512	P=0.441	P=0.973	1570/412	χ²=1.398，P=0.237
rs12346650	?	GG/GA/AA	?	?	?	G/A	?
?	病例组	84/116/37	0.983（0.742~1.303）	0.991（0.673~1.460）	0.953（0.545~1.666）	284/190	0.1.094（0.892~1.343）
?	对照组	371/488/132	P=0.907	P=0.965	P=0.638	1230/752	χ²=0.743，P=0.389

表4 按性别分层分析结果

SNPs（WT/HT/MT）	性别	组别	基因型，OR（95%CI）
SNPs（WT/HT/MT）	性别	组别	WT/HT/MT	相加模型	显性模型	隐性模型
rs2505901（CC/CT/TT）	男	病例组	99/31/6	0.774（0.489～1.226）	0.666（0.380～1.165）	1.128（0.344～3.696）
?	?	对照组	252/126/21	P=0.275	P=0.154	P=0.842
?	女	病例组	60/38/3	1.102（0.683～1.780）	1.203（0.687～2.109）	0.686（0.142～3.319）
?	?	对照组	369/202/21	P=0.691	P=0.518	P=0.639
rs12346650（GG/GA/AA）	男	病例组	43/65/28	1.323（0.895～1.957）	1.350（0.741～2.297）	1.696（0.824～3.491）
?	?	对照组	143/212/44	P=0.161	P=0.357	P=0.152
?	女	病例组	41/51/9	0.671（0.436～1.033）	0.752（0.430～1.315）	0.318（0.114～0.891）
?	?	对照组	228/276/88	P=0.070	P=0.318	P=0.029

表4 按性别分层分析结果

SNPs（WT/HT/MT）	性别	组别	基因型，OR（95%CI）
SNPs（WT/HT/MT）	性别	组别	WT/HT/MT	相加模型	显性模型	隐性模型
rs2505901（CC/CT/TT）	男	病例组	99/31/6	0.774（0.489～1.226）	0.666（0.380～1.165）	1.128（0.344～3.696）
?	?	对照组	252/126/21	P=0.275	P=0.154	P=0.842
?	女	病例组	60/38/3	1.102（0.683～1.780）	1.203（0.687～2.109）	0.686（0.142～3.319）
?	?	对照组	369/202/21	P=0.691	P=0.518	P=0.639
rs12346650（GG/GA/AA）	男	病例组	43/65/28	1.323（0.895～1.957）	1.350（0.741～2.297）	1.696（0.824～3.491）
?	?	对照组	143/212/44	P=0.161	P=0.357	P=0.152
?	女	病例组	41/51/9	0.671（0.436～1.033）	0.752（0.430～1.315）	0.318（0.114～0.891）
?	?	对照组	228/276/88	P=0.070	P=0.318	P=0.029

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Association study between microRNA-938 and TGFBR1 single nucleotide polymorphisms and hemorrhagic stroke

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